A patogenezis egy betegség kialakulását és a hozzá kapcsolódó eseményláncot vizsgálja, amelyek lépésről lépésre meghatározzák az érintett szervekhez tartozó sejtek és szövetek morfo-funkcionális változásait. Ezeket a változásokat kémiai, fizikai vagy biológiai tényezők (vírusok, baktériumok stb.) Okozhatják.
Míg az etiológia meghatározza az okokat, a patogenezis a következményeket tanulmányozza.
Az orvosi szövegek olvasásakor tehát olyan kifejezésekkel találkozhatunk, mint: mikrobiális patogenezis, gyulladásos patogenezis, vírusos patogenezis, malignus patogenezis (a betegség, általában a tumor tendenciája fokozatosan romlik, amíg potenciálisan halálos lesz). Sok betegség felismeri a különböző ok -okozati tényezőket (multifaktoriális etiológia), és még ennél is több olyan betegség, amelyet különböző evolúciós mechanizmusok jellemeznek (többszörös patogenezis).
