Kémiai szempontból a fondaparinux egy szintetikus szulfát -pentasacharid, amelynek kémiai szerkezete a frakcionálatlan heparin aktív részén alapul.
Hasonlóan más heparin gyógyszerekhez, a fondaparinuxot parenterálisan és különösen szubkután injekció formájában kell beadni a hatás érdekében. Bizonyos esetekben azonban a hatóanyagot speciális egészségügyi személyzet intravénásan is beadhatja.
Olaszországban a fondaparinux egyetlen Arixrtra® nevű gyógyszerkészítményben kapható. A gyógyszer előretöltött fecskendőkben lévő, használatra kész injekciós oldat formájában van. A gyógyszer kiadásához orvosi rendelvény szükséges. megismételhető; mivel azonban A osztályú gyógyszerként van besorolva, annak költségét (minden bizonnyal magas) a Nemzeti Egészségügyi Rendszer (NHS) megtérítheti.
